در روز سقوط هواپیمای مسافربری یعنی چهارشنبه، آیتالله خامنهای در پیامی کوتاه به این سانحه در کنار قربانیان مراسم تشییع جنازه قاسم سلیمانی اشاره کرد و نوشت: «حادثه تلخ و غمبار جان باختن جمعی از هممیهنان عزیز در هنگام بدرقه شهید عالیقدر و نیز حادثه مصیبتبار سقوط هواپیمای مسافربری و جان باختن مسافران ایرانی و غیر ایرانی، دو نقطه غمانگیز این دو روز است.»علی خامنهای، ۱۳تیر۱۳۷۰:
— حافظه تاریخی (@hafezeh_tarikhi) January 11, 2020
هواپیمای مسافربری را با قریب ۳۰۰ مسافر ساقط میکنید بعد میگویید اشتباه کردیم؟ غلط کردید اشتباه کردید. اشتباه کردیم یعنی چه؟ pic.twitter.com/4wJTfaVM3H