پس از پخش مستند بی بی سی، وزیر اطلاعات وعده داد که در یک کنفرانس خبری به "موارد مطرح شده" درباره پرونده ترور "دانشمندان هستهای" پاسخ دهد اما هنوز این نشست برگزار نشده است.
علی ربیعی، سخنگوی دولت ایران نیز درباره پخش این مستند گفته بود: "این اتفاق در دولت ما رخ نداده است. من نیز اطلاعی از این پرونده ندارم اما در گفتوگوهایی که در این باره داشتهام، اعترافاتی از سوی افرادی انجام شده که درست هم بوده است ولی اعترافاتی هم انجام شده که کار کارشناسی درباره آنها انجام نشده است."
آقای ربیعی همچنین گفت: "کارشناس این پروندهها کارشناس ضدجاسوسی نبوده است و کارشناسان حوزه دیگری بودهاند که در این پرونده کار کردهاند."
سخنگوی دولت بدون رد کردن آنچه در مستند پخش شد اضافه کرده بود که "همان موقع هم از این افراد دلجویی و عذرخواهی شده است."
غلامحسین اسماعیلی سخنگوی قوه قضائیه هم هفته گذشته گفت اگر مازیار ابراهیمی شکایتی دارد قوه قضائیه رسیدگی خواهد کرد اما او گزارش بیبیسی را "فریبکارانه" خواند.
اما علی مطهری، نایب رئیس مجلس ایران، گفته بود: "اینکه تروری اتفاق افتاده و بعد مسئولان امنیتی و اطلاعاتی کشور برای اینکه به سرعت جوابی به مردم بدهند و مسئولیت را از سر خود بازکنند، اقدام به بازداشت افرادی کنند و بعد هم آنان را تحت فشار به اعترافاتی درباره ترور دانشمندان هستهای ایران کنند و در صدا و سیمای جمهوری اسلامی هم نمایش دهند، اصلا متناسب با اخلاق و روشهای اسلامی ما نیست".
علی مطهری مازیار ابراهیمی هفت سال پیش به همراه ۱۲ نفر دیگر در یک برنامه تلویزیونی به نام "کلوب ترور" که از صدا و سیمای ایران پخش شد اعتراف کرد که به اسرائیل رفته، آنجا آموزش دیده و سپس برای ترور دانشمندان اتمی ایران به این کشور بازگشتهاند.
این اعترافات در دوران ریاست جمهوری محمود احمدی نژاد و وزارت حیدر مصلحی رخ داد اما متهمان حداقل یک سال در دوران حسن روحانی هم در زندان ماندند. نمایندگان مجلس نمیتوانند از حیدر مصلحی سوال کنند از این رو خواهان پاسخگویی وزیر فعلی اطلاعات شدهاند.
مقامهای ایران میگوید در فاصله سالهای ۱۳۸۸ تا ۱۳۹۰ چهار تن از دانشمندان هستهای ایران کشته شدند و یک دانشمند دیگر نیز از سوء قصد جان به در برده است.
نمایندگان مجلس نمیتوانند از حیدر مصلحی سوال کنند به همین جهت خواهان پاسخگویی وزیر فعلی اطلاعات شدهاند. برخی از فعالان سیاسی خواهان محاکمه حیدر مصلحی و عاملان این اعترافات ساختگی شدهاند. به گفته محمود صادقی، "در صورت احراز اشتباه، دادسرای نظامی میتواند به موضوع مازیار ابراهیمی وارد شود."